MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. natto BEST195 plasmid pBEST195S

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017194	ATC	2	6	190	195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428277406
2	NC_017194	GACG	2	8	248	255	25 %	0 %	50 %	25 %	428277406
3	NC_017194	A	6	6	316	321	100 %	0 %	0 %	0 %	428277406
4	NC_017194	TG	3	6	431	436	0 %	50 %	50 %	0 %	428277406
5	NC_017194	ATA	2	6	467	472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428277406
6	NC_017194	TGGA	2	8	510	517	25 %	25 %	50 %	0 %	428277406
7	NC_017194	ATG	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428277406
8	NC_017194	GAA	2	6	673	678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277406
9	NC_017194	ATC	2	6	686	691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428277406
10	NC_017194	TGT	2	6	704	709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428277406
11	NC_017194	GAA	2	6	717	722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277406
12	NC_017194	TTG	2	6	806	811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428277406
13	NC_017194	ATG	2	6	880	885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428277406
14	NC_017194	TGT	2	6	936	941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428277406
15	NC_017194	AGA	2	6	960	965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277406
16	NC_017194	GAT	2	6	991	996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428277406
17	NC_017194	CCG	2	6	1008	1013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428277406
18	NC_017194	GGA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428277406
19	NC_017194	GAA	2	6	1102	1107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277406
20	NC_017194	CGAA	2	8	1121	1128	50 %	0 %	25 %	25 %	428277406
21	NC_017194	TA	3	6	1327	1332	50 %	50 %	0 %	0 %	428277407
22	NC_017194	TGT	2	6	1335	1340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428277407
23	NC_017194	T	6	6	1340	1345	0 %	100 %	0 %	0 %	428277407
24	NC_017194	TAT	2	6	1347	1352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277407
25	NC_017194	ATT	2	6	1359	1364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277407
26	NC_017194	AGG	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428277407
27	NC_017194	TAT	2	6	1440	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277407
28	NC_017194	TGT	2	6	1446	1451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428277407
29	NC_017194	TAT	2	6	1460	1465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277407
30	NC_017194	CTG	2	6	1481	1486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428277407
31	NC_017194	ATT	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277407
32	NC_017194	CAA	2	6	1538	1543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428277407
33	NC_017194	GAAAG	2	10	1647	1656	60 %	0 %	40 %	0 %	428277407
34	NC_017194	CATA	2	8	1720	1727	50 %	25 %	0 %	25 %	428277407
35	NC_017194	ATT	2	6	1779	1784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277407
36	NC_017194	A	6	6	1804	1809	100 %	0 %	0 %	0 %	428277407
37	NC_017194	AAAAG	2	10	1986	1995	80 %	0 %	20 %	0 %	428277408
38	NC_017194	CTT	2	6	2045	2050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428277408
39	NC_017194	T	6	6	2059	2064	0 %	100 %	0 %	0 %	428277408
40	NC_017194	ATT	2	6	2125	2130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277408
41	NC_017194	ATA	2	6	2177	2182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428277408
42	NC_017194	GGAAA	2	10	2192	2201	60 %	0 %	40 %	0 %	428277408
43	NC_017194	A	6	6	2199	2204	100 %	0 %	0 %	0 %	428277408
44	NC_017194	CA	3	6	2206	2211	50 %	0 %	0 %	50 %	428277408
45	NC_017194	GAA	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277408
46	NC_017194	ACC	2	6	2265	2270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428277408
47	NC_017194	TTA	2	6	2274	2279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277408
48	NC_017194	TCTT	2	8	2305	2312	0 %	75 %	0 %	25 %	428277408
49	NC_017194	ATA	2	6	2313	2318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428277408
50	NC_017194	GAT	2	6	2459	2464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428277408
51	NC_017194	T	6	6	2489	2494	0 %	100 %	0 %	0 %	428277408
52	NC_017194	AAT	2	6	2520	2525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428277408
53	NC_017194	TCA	2	6	2875	2880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428277409
54	NC_017194	A	6	6	2895	2900	100 %	0 %	0 %	0 %	428277409
55	NC_017194	A	6	6	2944	2949	100 %	0 %	0 %	0 %	428277409
56	NC_017194	A	6	6	3040	3045	100 %	0 %	0 %	0 %	428277409
57	NC_017194	GAG	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428277409
58	NC_017194	GCG	2	6	3152	3157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428277409
59	NC_017194	CTC	2	6	3244	3249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428277409
60	NC_017194	CT	3	6	3291	3296	0 %	50 %	0 %	50 %	428277409
61	NC_017194	T	7	7	3305	3311	0 %	100 %	0 %	0 %	428277409
62	NC_017194	GAT	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428277409
63	NC_017194	GCG	2	6	3388	3393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428277409
64	NC_017194	AAG	2	6	3405	3410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277409
65	NC_017194	AAAT	2	8	3433	3440	75 %	25 %	0 %	0 %	428277409
66	NC_017194	AG	4	8	3496	3503	50 %	0 %	50 %	0 %	428277409
67	NC_017194	A	6	6	3549	3554	100 %	0 %	0 %	0 %	428277409
68	NC_017194	GCG	2	6	3857	3862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428277409
69	NC_017194	GAA	2	6	3885	3890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277409
70	NC_017194	GAC	2	6	3929	3934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428277409
71	NC_017194	CTAAAA	2	12	4014	4025	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428277409
72	NC_017194	AAG	2	6	4077	4082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277409
73	NC_017194	A	7	7	4127	4133	100 %	0 %	0 %	0 %	428277409
74	NC_017194	AG	4	8	4151	4158	50 %	0 %	50 %	0 %	428277409
75	NC_017194	AATA	2	8	4275	4282	75 %	25 %	0 %	0 %	428277409
76	NC_017194	CAAT	2	8	4315	4322	50 %	25 %	0 %	25 %	428277410
77	NC_017194	CCA	2	6	4339	4344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428277410
78	NC_017194	T	7	7	4346	4352	0 %	100 %	0 %	0 %	428277410
79	NC_017194	TGG	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428277410
80	NC_017194	T	6	6	4371	4376	0 %	100 %	0 %	0 %	428277410
81	NC_017194	T	6	6	4434	4439	0 %	100 %	0 %	0 %	428277410
82	NC_017194	TTC	2	6	4477	4482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428277410
83	NC_017194	TCG	2	6	4586	4591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428277410
84	NC_017194	AGTG	2	8	4592	4599	25 %	25 %	50 %	0 %	428277410
85	NC_017194	TTC	2	6	4702	4707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428277410
86	NC_017194	TGA	2	6	4771	4776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428277410
87	NC_017194	GAA	2	6	4995	5000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277411
88	NC_017194	GAA	2	6	5046	5051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277411
89	NC_017194	TACA	2	8	5052	5059	50 %	25 %	0 %	25 %	428277411
90	NC_017194	CTTT	2	8	5073	5080	0 %	75 %	0 %	25 %	428277411
91	NC_017194	GATGT	2	10	5081	5090	20 %	40 %	40 %	0 %	428277411

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.